Se ha mejorado la funcionalidad de FOBI. La sensibilidad de la cámara se mejora aproximadamente 3 veces y la fuente de luz de excitación también es hasta 10 veces más fuerte que antes. Además, FOBI 2 minimiza la interferencia de imágenes fluorescentes al cambiar la ubicación de la fuente de luz (ángulo de luz: 67º a 45º). Además, se agrega un lecho calefactor para proteger a los organismos experimentales de la hipotermia.